為進一步貫徹落實國資委批復的《重組方案》，在重組組建一年后，中國煤炭科工集團開始對集團公司重要三級子企業實施扁平化管理，并對組織架構進行了調整，將17戶重要三級子企業調整為煤炭科工集團二級子企業。至此，煤炭科工集團管理的二級子企業從原來的中煤國際、煤科總院、天地科技3戶增加到了20戶，同時大幅減少了管理層級。通過實施扁平化管理，中國煤炭科工集團壓縮了管理層級，并為進一步深度重組和實現股份制改造奠定了基礎。