2008年11月4日，海峽兩岸關系協會會長陳云林與臺灣海峽交流基金會董事長江丙坤，在臺北簽署了《海峽兩岸海運協議》等四項協議，其中《海峽兩岸海運協議》的簽署將給中國長航集團長航油運的生產經營，尤其是化工特種運輸和成品油運輸帶來積極影響。

　　海峽兩岸正式直航之后對于長航油運生產經營來說意義深遠，影響積極。首先是可降低運輸成本。原臺灣到大陸的貨物運輸必須通過第三方中轉，直航之后，減少了燃油和時間消耗，為船東節約了運輸成本。如原來臺灣到上海的油品運輸必須到日本換單，船期約2天多，直航之后可節約半天時間；其次是提高了大陸船舶的經營便利。原臺灣到大陸的運輸只有懸掛國外旗和方便旗的船舶才能承運，兩岸直航之后，長航油運MR船和化工特種船均可參與兩岸油品、化工品、瀝青的運輸，大大提高了長航油運船舶經營攬貨的能力；再次是為長航油運增加了運輸貨源選擇。在該協議簽訂之前，臺灣和大陸之間每年約200多萬噸化學品運輸貨源，承運船舶主要是韓國船東，兩岸直航之后將給兩岸船舶更多的機會，而從直航中所獲得的成本優勢，相當于可給中國船東增加了至少200萬噸化學品運輸貨源的運輸需求。直航之后，可以大大提高大陸船舶由韓國到華南的貨源的競爭力。

　　海峽兩岸直航之后改變了兩岸運輸的性質，為長航油運船舶運輸特別是化工特種品運輸擴大了運輸市場，提高了長航公司在遠東市場的競爭力。