2012年12月29日，中鐵十局承建的廈門車站改擴建工程第一階段建設啟動。該工程造價8.87億元，共需完成鋪軌9.5公里，新鋪站臺3萬余平米，雨棚搭設3.7萬平米，計劃于2015年底竣工。建成后最高聚集人數將從目前的1500人升至4000人以上，站場由目前的3站臺5股道擴至5站臺9股道，預測年發送量達1250萬人次。