2008年10月16日在北京，中國科學院與中國三峽總公司簽訂全面戰略合作協議。全國人大常委會副委員長、中國科學院院長路甬祥院士出席簽字儀式并發表重要講話。

　　中國科學院與中國三峽總公司的合作，以科學發展觀為指導，以“平等互利、優勢互補、相互協作、共同發展”為原則，以促進我國水電產業和其他清潔能源產業又好又快、可持續發展為目標，不斷增加合作層次，拓寬合作領域，創新合作模式，探索建立企業需求牽引、充分發揮中科院科技和人才優勢以及中國三峽總公司資源和管理優勢、院企共同發展的科技創新體系。

　　協議指出，雙方將在大型水電工程建設和運行的重大科學技術問題、新能源開發重大技術、清潔煤化工關鍵技術、水電及其他清潔能源工程的生態與環境保護技術、大型水電工程建設區域的經濟發展以及移民安置等領域開展廣泛深入合作。雙方將聯合申請和開展科研項目，共建合作平臺，建立人員交流、互派機制，發揮中國科學院院士科技咨詢作用，共同推進科研成果轉化應用。此次雙方在簽訂戰略合作協議的同時，還簽訂了5個具體合作項目協議。