2019年，南通港貨物吞吐量達3.36億噸，同比增長25.9%。

支撐南通港貨物吞吐量大幅增長的主要是四大類貨種：礦建材料完成13357.3萬噸，同比增長107.1%；煤炭完成6773.6萬噸，同比增長11.6%；石油天然氣及制品完成2301.7萬噸，同比增長10.5%；水泥完成2141.2萬噸，同比增長16.4%。

2019年南通港集裝箱吞吐量同樣快速增長，共完成集裝箱吞吐量154.2萬標箱，同比增長59.3%。2018年6月開港的通海港區不斷刷新記錄，共完成集裝箱吞吐量113.6萬標箱，同比增長70.9%；如皋港區完成40.5萬標箱，同比增長33.6%。

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