兗礦集團通過持續技術創新體系建設和產、學、研聯合，不斷提升自主創新能力，大力開展煤炭安全高效開采和潔凈綜合利用技術研究，探索出一條傳統資源型企業依靠科技創新，優化調整產業結構，實現安全、高效、可持續發展的新模式。2009年，集團公司被國家科技部、國務院國資委、中華全國總工會聯合確定為國家級“創新型試點企業”，被省政府授予“產學研合作創新突出貢獻獎”。

　　一是加強研發平臺建設。集團公司先后建成水煤漿氣化及煤化工國家工程研究中心、國家級企業技術中心、企業博士后科研工作站、煤液化及煤化工國家重點實驗室等高層次的技術創新平臺，擁有“煤液化及煤化工”、“綜采放頂煤技術”兩個泰山學者設崗領域。2009年在已設立的30個專業技術研究所的基礎上，依據各單位技術優勢和專業特色命名24個創新團隊，進一步完善了企業技術創新體系。

　　二是加強制度建設，保證研發投入。逐步建立和完善技術創新的運行、激勵和保障機制。重新修訂集團公司《科技創新工作管理辦法》、《專利工作管理辦法》、《科技進步獎獎勵辦法》等規章制度。各項措施的有機結合，形成了適用、靈活、高效的創新體系運行機制，科技創新研發投入得到有效保證，研發投入占銷售收入的比例逐年提高。2009年科技創新投入16.25億元，占產品銷售收入的比例達到4.3%，居于全國煤炭行業前列。

　　三是一批重點科技成果獲得上級獎勵。2009累計獲得省部級以上科技進步獎42項次，其中：國家科技進步二等獎2項，?。ú浚┘壙萍歼M步獎一等獎2項，其他省部級以上獎勵38項次?！白詣踊彭斆宏P鍵技術與裝備研發及其在國內外的應用”、“高效潔凈煤制甲醇與聯合循環集成系統的研發和示范”兩項成果榮獲國家科技進步二等獎?！皟贾莸V區高硫煤潔凈利用創新技術集成及工業化示范”榮獲山東省科技進步一等獎。46項科技成果通過上級有關部門組織的技術鑒定，其中達到國際先進以上水平科技成果39項。

　　四是知識產權管理工作再上新水平。完成全國知識產權示范創建單位示范創建工作，被國家知識產權局確定為首批全國知識產權示范單位。全年申請專利44項，其中發明專利21項；獲得授權專利40項，其中發明專利8項。